广州医科大学团委以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，扎实推进共青团改革等各项工作。曾被团中央评为2018年大学生志愿者“三下乡”社会实践活动先进单位，先后创建全国青年文明号6个、广东省青年文明号15个、广州市青年文明号54个，团委微信公众号在2019年10月排名“全国普通高校团委微信公众号综合影响力”第2名、“广东省高校团委微信公众号综合影响力”第1名，被团广东省委授予“优秀新媒体奖”。战“疫”期间，广州医科大学团委带领全校21个直属团组织、399个团支部和团员青年大学生积极参与疫情防控工作，先后成立17支青年战“疫”突击队，共有队员超过1000人，其中团员561人。广州医科大学优秀青年、附属第一医院重症医学科副主任医师桑岭同志获得“全国卫生健康系统新冠肺炎疫情防控工作先进个人”称号；广州南站防控疫情志愿服务队被“共青团中央”微信公众号表扬；附属第一医院“90后”团员李颖贤同志在湖北武汉抗疫一线“火线入党”；公共卫生学院大学生肖建海同学“火线入团”；附属脑科医院制作了《抗疫科普视频系列》视频等，《人民日报（网络版）》刊登题为《广州市学联、市少工委发起战“疫”暖心行动》的报道，详细介绍了共青团积极参与防控疫情工作的事迹。